一、在主体执法职位上的区别
凭证《中华人民共和国公司法》（中华人民共和国主席令第42号）第十四条划定：“公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司挂号机关申请挂号，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司肩负。”
“公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法自力肩负民事责任。”
由此可见，在主体执法职位上它们是完全差别的：
1、子公司在执法上是一个自力的法人，依法自力肩负民事责任，即：以自己的名义举行种种民事经济运动；自力肩负公司行为所带来的一切效果与责任。
2、分公司在执法上不是一个自力的法人，不具有自力肩负民事责任的资格，也就是说它在执法上是隶属于总公司的一个分支机构，不是自力的个体。
二、在关联关系上的区别
1、子公司：
母公司与子公司之间一样平常体现的是股份的控制与被控制关系，也许是全资控制，也许是最大股东的控制。子公司在经济和决议上受母公司的支配与控制，但在执法上，子公司是自力的法人。
子公司拥有自力的名称和公司章程；具有自力的组织机构；拥有自力的工业。
子公司实验自力核算、自尊盈亏。
2、分公司：
总公司与分公司之间一样平常体现为是总机构与分机构的关系，具有隶属的特征。分公司在实质上就是总公司的一个安顿在异地的派出机构。
分公司一样平常都不是完全自力核算单位，盈亏只是一种业绩审核。
子公司可以建设分公司，但分公司不可能拥有子公司。
三、在税务处理上的区别
（一）子公司的处理
子公司是作为自力法人，实验自力核算并自力申报纳税，是完全自力的纳税人，肩负周全的纳税义务。
（二）分公司的处理
分公司作为分支机构的一种，适用总分机构的相关政策。
总机构和分支机构应依法治理税务挂号，接受所在田主管税务机关的监视和治理。
1、企业所得税方面
（1）凭证《国家税务总局关于印发〈跨地区谋划汇总纳税企业所得税征收治理步伐〉的通告》(国家税务总局通告2012年第57号)（以下简称“税总2012年57号通告”）划定，住民企业在中国境内跨地区（指跨省、自治区、直辖市和妄想单列市，下同）设立不具有法人资格分支机构的，该住民企业为跨地区谋划汇总纳税企业（以下简称汇总纳税企业）�；阕苣伤捌笠凳笛�“统一盘算、分级治理、就地预缴、汇总整理、财务调库”的企业所得税征收治理步伐。
汇总纳税企业凭证《企业所得税法》划定汇总盘算的企业所得税，包括预缴税款和汇算清缴应缴应退税款，50%在各分支机构间分摊，各分支机构凭证分摊税款就地治理缴库或退库；50%由总机构分摊缴纳，其中25%就地治理缴库或退库，25%就地全额缴入中央国库或退库。
（2）关于以总机构名义举行生产谋划的不法人分支机构，无法提供汇总纳税企业分支机构所得税分派表，也无法提供“税总2012年57号通告”第二十三条划定的相关证据证实其二级及以下分支机构身份的，应视同自力纳税人盘算并就地缴纳企业所得税。
（3）凭证《浙江省国家税务局浙江省地方税务局关于省内跨市、县谋划汇总纳税企业所得税征管问题的通告》（浙江省国家税务局浙江省地方税务局通告2013年第3号）划定，浙江省内汇总纳税企业所得税盘算、预缴、汇算清缴治理参照“税总2012年57号通告”执行。
因此，关于分公司的企业所得税治理：切合划定条件的汇总纳税的分公司，实验“就地预缴、汇总整理”；无法提供汇总纳税企业分支机构所得税分派表，又无法证实分支机构的，凭证自力纳税人就地缴纳企业所得税；分公司实验自力核算、不汇总纳税的，凭证自力纳税人就地缴纳企业所得税。
关于列名企业的下属二级分支机构均应凭证企业所得税的有关划定向当田主管税务机关报送企业所得税预缴申报表或其他相关资料，但其税款由总机构统一汇总盘算后向总机构所在田主管税务机关缴纳。如：《国家税务总局关于中国工商银行股份有限公司等企业企业所得税有关征管问题的通知》（国税函[2010]184号）的列名企业。
2、增值税方面
（1）分公司（属于分支机构的组成部分，为便于与文件对接，以下统称分支机构）销售货物、提供加工修理修配劳务的增值税的纳税所在
凭证《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十二条划定，牢靠业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在统一县（市）的，应当划分向各自所在地的主管税务机关申报纳税。因此，分支机构的增值税一样平常情形下就地申报纳税。
可是，该条同时划定，经国务院财务、税务主管部分或者其授权的财务、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
《财务部、国家税务总局关于牢靠业户总分支机构增值税汇总纳税有关政策的通知》（财税[2012]9号）对上述划定进一步明确：牢靠业户的总分支机构不在统一县（市），但在统一�。ㄇ⑹校┕婺Ｄ诘�，经�。ㄇ⑹校┎莆裉ň郑⒐宜拔窬稚笈蕹�，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报缴纳增值税。�。ㄇ⑹校┎莆裉ň郑⒐宜拔窬钟笈蕹傻男Ч�，上报财务部、国家税务总局备案。
在现实事情中，增值税由总机构统一汇总核算、统一申报缴纳的主要是连锁谋划企业。如：《浙江省国家税务局关于连锁谋划企业增值税汇总纳税有关问题的通知》（浙国税流[2005]76号）第三条划定，“经批准汇总缴纳增值税的连锁谋划企业总店应按统一核算确当月应缴增值税总额向所在田主管国税机关申报纳税，即总店应纳增值税=所有总、门店销项税额-所有总、门店进项税额；门店应纳增值税为零。”因此，增值税汇总缴纳需要总机构统一核算，分支机构自力核算的不可汇总缴纳。
（2）统一核算的总分机构之间的货物移送作视同销售的特殊划定
先将相关划定归集：
①《增值税暂行条例实验细则》第4条视同销售货物行为的第（3）项：设有两个以上机构并实验统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售，但相关机构设在统一县（市）的除外。
②《国家税务总局关于企业所属机构间移送货物征收增值税问题的通知》（国税发[1998]137号）划定，《实验细则》第4条视同销售货物行为的第（3）项所称的用于销售，是指受货机构爆发以下情形之一的谋划行为：向购货方开具发票；向购货方收取货款。受货机构的货物移送行为有上述两项情形之一的，应当向所在地税务机关缴纳增值税；未爆发上述两项情形的，则应由总机构统一缴纳增值税。若是受货机构只就部分货物向购置方开具发票或收取货款，则应当区别差别情形盘算并划分向总机构所在地或分支机构所在地缴纳税款。
③《国家税务总局关于纳税人以资金结算网络方法收取货款增值税纳税所在问题的通知》（国税函[2002]802号）划定，纳税人以总机构的名义在各地开立账户，通过资金结算网络在各地向购货方收取销货款，由总机构直接向购货方开具发票的行为，不具备《国家税务总局关于企业所属机构间移送货物征收增值税问题的通知》（国税发[1998]137号）划定的受货机构向购货方开具发票、向购货方收取货款两种情形之一，其取得的应税收入应当在总机构所在地缴纳增值税。
一最先看实验统一核算纳税人的机构之间货物移送视同销售处理上述三个文件很难明确，感受好饶口舌，逐步思索后悟出了道道：
实验统一核算纳税人的总分机构之间，总机构将货物移送到分支机构，若是分支机构将移送到的货物对外销售时使用分支机构外地的发票向购货方开具发票或者向购货方收取货款，只要知足这两个条件之一的，这部分货物销售的增值税需要在分支机构所在地缴纳税款。总机构在货物移送时就需要视同销售，开具专用发票给分支机构抵扣。但若是总机构统一收款、统一开票，这部分货物销售应当在总机构所在地缴纳增值税。
（3）营改增（即应税效劳）纳税人总机构汇总缴纳增值税划定
凭证《财务部国家税务总局关于重新印发〈总分机构试点纳税人增值税盘算缴纳暂行步伐〉的通知》（财税[2013]74号）划定，经财务部和国家税务总局批准的总机构试点纳税人及其分支机构，可以按该步伐汇总盘算申报缴纳增值税。
营改增纳税人总、分支机构汇总申报缴纳增值税时，仅对应税效劳项目举行汇总，总、分支机构销售货物、提供加工修理修配劳务，凭证增值税暂行条例及相关划定就地申报缴纳增值税。
总机构将总分机构应税效劳营业的应交增值税举行汇总，抵减各分支机构对应应税效劳营业已缴纳的增值税税款后，在总机构所在地申报缴纳增值税。
各分支机构爆发应税效劳营业，凭证应征增值税销售额和预征率盘算缴纳增值税。盘算公式如下：
应预缴的增值税＝应征增值税销售额×预征率
预征率由财务部和国家税务总局划定，并适时予以调解。
总之，子公司是自力的纳税人，完整的纳税主体。分公司是隶属于总公司的，一样平常情形下，在增值税上凭证属地原则作为自力纳税人就地自力申报纳税，但经审核确认，切合条件的也可以汇总缴纳，其中营改增应税效劳部分需要按预征率预缴；在所得税上，自力核算的作为自力纳税人就地自力申报纳税，统一核算的实验“统一盘算、分级治理、就地预缴、汇总整理、财务调库”的企业所得税征收治理步伐。
泉源：一叶税舟
